A szabadkai zsinagóga orgonája 1902-ben készült Wegenstein Lipót temesvári orgonaépítő műhelyében. Az orgonát 1940-ig használták szertartások alkalmával, valamint különböző rendezvényeken. A II. világháború végett és az ezt követő évtizedeken  át az orgona sorsára   lett hagyva. Amikor a zsinagóga felújítására került sor, az orgona restaurálásának kérdése is felmerült. Végül is, több forrásból  2021-re Apró  Tibor műhelye felújította za orgonát. Ugyanebben az évben szeptember l5-én  ünnepi keretek közt át lett adva az orgona. Azóta az orgona használatban van rendeltetésének megfelelően. Az elmult héten a zsinagóga 120-ik évfordulójára orgonahangversennyel emlékeztek   meg. Az orgonán a budapesti Hajdók Judit Liszt Ferenc díjjas művésznő játszott. A koncerten F.M.Bartholdy, J.S.Bach, M. Ravel, Liszt Ferenc, Antalffy Zsiros, J.Brahms és T.Dubois művei csendűltek fel. A hangverseny keretében  megemlékezés volt a 120 éves templomról, valamint méltatták az orgonát, amely teljesen eredeti formában és pompában lett vissza adva szolgáltatásának.